Gian Carlo Agnoli è stato libero docente in Patologia speciale medica e in Fisiologia umana e professore ordinario e titolare di successivi insegnamenti internistici (Fisiopatologia medica, Semeiotica medica, Medicina interna) della Facoltà di Medicina e Chirurgia nell’Alma Mater Studiorum.
Ha contribuito alla collana ECM (Educazione continua in medicina) con le monografie: Ipertensioni Arteriose Endocrine (2003), Potassio: Omeostasi e Disordini (2005), Dalle specie reattive dell’ossigeno all’ipertensione arteriosa (ristampa riveduta e corretta, 2009), Sistema renina-angiotensina-aldosterone. Fisiopatologia (2011, 2015).